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根据中央空调系统工作原理，空气在流通过程中都必须经过管道，而由于空调风管湿度高，长期密闭，不便于清洁，所以容易成为病毒滋生的“温床”.
绝大部分公共场所的空调，都是晚上关闭第二天早上重新启动。由于关闭期间整个空调系统尤其是风管停止新风进入，从而导致整个风管内的湿度达到80％甚至更高，为细菌滋生提供了一个最佳的环境。早上空调开启时，人们会闻到浓浓的臭味，这正是空调内细菌向外界扩散的最危险时期。
据检测专家报告，无论在何场所，中央空调、分体及柜式空调，均能检出细菌及毒菌；非中央空调通过滤网与热交换器中的细菌与霉菌污染明显高于中央空调。通过对空调系统中的菌谱分析可知，空调系统中主要是蜡样芽孢杆菌的污染，最高检出达到100％；其次是霉菌、金黄色葡萄球菌，平均检出水平在10％左右；军团菌主要在过滤网，平均检出水平在5％。
这些病原体对人体健康都有着较大的潜在危害。人长时间呆在空调室内，就会感到头晕、乏力、免疫力下降，严重者就会罹患呼吸道等疾病，即“空调病”。一些发达国家，如日本、西欧等国，他们的空调每年至少清洗消毒一次，而我国则在近两年刚刚开始。
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